При МОУ Жиндойской СОШ функционирует структурное подразделение пришкольный интернат на 15 мест. В интернате проживают учащиеся 5-11 классов из села Жиндокон и села Хилкотой. Режим работы пришкольного интерната - пятидневная рабочая неделя с понедельника по пятницу круглосуточно, суббота и воскресенье выходные дни. В интернате имеется 5 комнат для проживания, туалеты, душевые. Штат работников интерната - 2 воспитателя, 2 младших воспитателя. График работы - сменный.